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DIA定量蛋白質(zhì)組

產(chǎn)品簡(jiǎn)介

DIA技術(shù)主要采用數(shù)據(jù)非依賴性采集模式（Data-Independent Acquisition，DIA），通過液質(zhì)聯(lián)用技術(shù)（LC-MS/MS）將整個(gè)質(zhì)譜掃描質(zhì)量范圍分為若干個(gè)窗口，依次對(duì)每個(gè)窗口的所有離子進(jìn)行碎裂，采集全部子離子信息。

研究方法

DIA流程圖

技術(shù)優(yōu)勢(shì)

全景式掃描，采集所有離子及碎片譜圖，數(shù)據(jù)無遺漏；

鑒定敏感度高，可以鑒定更多低豐度蛋白；

蛋白質(zhì)覆蓋率、定量準(zhǔn)確性高；

DIA缺失值更少，結(jié)果可重復(fù)性高，數(shù)據(jù)可回溯。

案例解析

家族性帕金森病患者尿蛋白質(zhì)組分析^[1]

研究背景

帕金森?。?/span>PD）的患病率正在上升，但是新的治療策略和治療方法的發(fā)展改變了疾病的進(jìn)程，這將得益于特異、敏感和無創(chuàng)的生物標(biāo)志物來早期檢測(cè)PD。

研究目的

通過尿液蛋白組學(xué)進(jìn)行突變攜帶者的突變狀態(tài)和疾病表現(xiàn)進(jìn)行分類，以及尋找帕金森發(fā)生發(fā)展生物標(biāo)志物。

研究結(jié)果

基于DIA蛋白組學(xué)技術(shù)對(duì)家族性帕金森病（PD）患者的尿液進(jìn)行測(cè)序分析尋找，揭示了具有LRRK2 G2019S突變的個(gè)體中溶酶體失調(diào)，結(jié)合機(jī)器學(xué)習(xí)，發(fā)現(xiàn)尿蛋白組學(xué)對(duì)于PD患者的生物標(biāo)志物發(fā)現(xiàn)和患者分層具有重要研究價(jià)值。

基于質(zhì)譜的兩個(gè)獨(dú)立尿液PD隊(duì)列的蛋白質(zhì)組學(xué)分析流程

參考文獻(xiàn)

[1] Urinary proteome profiling for stratifying patients with familial Parkinson's disease[J]. EMBO Molecular Medicine, 2021.