廣泛靶向代謝組學(xué)
技術(shù)簡介
廣泛靶向代謝組學(xué)（Widely targeted metabonomics）是一種整合了非靶向代謝組學(xué)“廣泛性”和靶向代謝組學(xué)“準(zhǔn)確性”檢測技術(shù)優(yōu)點的新型代謝組檢測技術(shù)，屬于新一代代謝組檢測技術(shù)。項目實測結(jié)果可達(dá)一次性定性定量檢測800-1200種代謝物質(zhì)。
技術(shù)原理
將目標(biāo)化合物的質(zhì)譜參數(shù)（RT、Q1、Q3）信息添加進(jìn)廣靶數(shù)據(jù)庫中，構(gòu)建一個包含數(shù)據(jù)庫中所有化合物信息的質(zhì)譜方法?；谝褬?gòu)建數(shù)據(jù)庫及檢測方法，采用MRM掃描模式采集樣本代謝組數(shù)據(jù)，獲得物質(zhì)的定性及相對定量結(jié)果。
服務(wù)產(chǎn)品：
技術(shù)特點
通量高，數(shù)據(jù)庫大：廣靶數(shù)據(jù)庫收錄幾千種代謝物，含大量次生代謝物
分辨率、靈敏度高：檢測下限達(dá)pg級，可發(fā)現(xiàn)更多低豐度代謝物
定性定量準(zhǔn)：AB 6500+三重四極桿定量；自建標(biāo)品數(shù)據(jù)庫準(zhǔn)確定性結(jié)果
覆蓋廣，注釋信息全面：覆蓋KEGG中90%以上pathway，通路及功能分析準(zhǔn)確可靠
技術(shù)路線：
送樣建議：
（1）樣本量要求：
血清/血漿：200 μL/sample
尿液：1mL/sample
動物組織：200mg/sample
糞便/腸道內(nèi)容：200mg/sample
植物組織：1-2g/sample
（2）生物學(xué)重復(fù)：
植物：建議8個以上，不低于6個
動物：建議12個以上，不低于8個
臨床樣品：建議100個以上，不低于30個
案例分析
廣泛靶向的代謝組學(xué)分析尸體分解對不同類型水體中代謝特征的影響[1]
研究背景
動物尸體在降解過程中會產(chǎn)生許多有毒有害的代謝物，對水安全構(gòu)成潛在的生態(tài)風(fēng)險，從而威脅人類健康。然而，動物尸體分解產(chǎn)生的代謝物尚不清楚。
研究目的
選擇了尸體分解最終階段（第19天）的樣本來研究代謝特征并以魚類為動物模型，通過廣泛靶向的代謝組學(xué)，揭示兩種水（黃河水和自來水）中水質(zhì)、微生物和有害代謝物之間的關(guān)系。
研究結(jié)果
結(jié)果顯示氨基酸代謝組學(xué)、吲哚及其衍生物、吡啶和吡啶衍生物主要發(fā)生在尸體組中，表明這些代謝物是尸體分解的標(biāo)志物。一些有害代謝物（如多胺、胺類、苯和取代衍生物）與尸體分解高度相關(guān)，這揭示了如何研究水中有害物質(zhì)的新見解。這項工作表明，尸體分解通過產(chǎn)生各種有毒代謝物導(dǎo)致水質(zhì)惡化，從而為暴露于水生環(huán)境中的動物尸體時的有毒代謝物提供了新的見解。
圖1 廣泛靶向代謝組學(xué)分析尸體分解產(chǎn)生有毒代謝物整體思路
參考文獻(xiàn)
[1] Zhou R, Yu Q, Li T, et al. Carcass decomposition influences the metabolic profiles and enriches noxious metabolites in different water types by widely targeted metabolomics[J]. Chemosphere, 2020, 269:129400.
全國免費熱線：400-6700-360
閩ICP備19023500號
閩公網(wǎng)安備 35010202001014號